Logo with a white Z-shaped mark and 'THOTIS MASTER' in white/orange on a dark blue gradient; below, bold French title text reads 'MASTER ÉCOLOGIE ET BIOLOGIE FONCTIONNELLE' on white banners.

Le Master Écologie et Biologie Fonctionnelle : matières, débouchés…

Le Master Écologie et Biologie Fonctionnelle (Functional Biology and Ecology) est un diplôme national de bac+5 (120 ECTS), enregistré au RNCP au niveau 7 (fiche RNCP41861). Mention très récente et rare, il est co-accrédité par deux universités publiques du sud de la France et se distingue par un cursus intégralement en anglais, ouvert à l’international.

Sa spécificité : former à l’interface entre l’écologie-évolution et la biologie fonctionnelle (génétique, génomique, biochimie), pour comprendre comment les organismes vivants sont affectés par les modifications de leur milieu et s’adaptent aux changements de leur environnement, du niveau moléculaire jusqu’aux populations et aux écosystèmes. Le master offre ainsi une réponse interdisciplinaire aux défis de la transition écologique et prépare aux métiers émergents de l’interface biologie-environnement.

La pédagogie est active et immersive : immersion dans les laboratoires de recherche partenaires, projet collectif Junior Lab de 5 mois mené en autonomie, interventions de chercheurs étrangers et stage individuel de 6 mois pouvant être réalisé à l’étranger. La formation prépare aussi bien au doctorat qu’à l’insertion dans les métiers de l’environnement, des sciences végétales et de la recherche.

📌 FAQ : Tout savoir sur le Master Écologie et Biologie Fonctionnelle

C'est quoi exactement le Master Écologie et Biologie Fonctionnelle ?

C’est un diplôme national bac+5 (120 ECTS) de niveau 7 au RNCP (fiche RNCP41861), co-accrédité par deux universités publiques du sud de la France. Il forme à l’interface entre l’écologie-évolution et la biologie fonctionnelle (génétique, génomique, biochimie) pour comprendre comment le vivant s’adapte aux changements de son environnement, et apporte une réponse interdisciplinaire aux défis de la transition écologique.

Quelles licences permettent d'y accéder ?

Le vivier principal est constitué des titulaires d’une licence Sciences de la vie, d’une licence de Biologie ou d’une licence SVT. Tout diplôme bac+3 jugé équivalent par la commission pédagogique peut aussi être recevable, y compris des profils internationaux.

Comment candidater au master ?

Pour l’entrée en M1, la candidature passe par la plateforme nationale Mon Master, avec relevés de notes, CV et lettre de motivation. Le dossier doit démontrer un solide niveau scientifique, un bon niveau d’anglais et un projet tourné vers la recherche ou les métiers de l’interface biologie-environnement.

Le master est-il sélectif ?

Oui. Cette mention très récente n’est proposée que sur un site, avec une promotion volontairement réduite pour permettre une pédagogie par immersion dans les laboratoires. Les résultats académiques, le niveau d’anglais et la cohérence du projet de recherche sont déterminants.

Quelles matières étudie-t-on ?

Au programme : écologie et évolution, génétique et génomique, biochimie, modélisation et mathématiques appliquées à la biologie, statistiques et bioinformatique (y compris séquençage nouvelle génération), agroécologie et santé des plantes, ainsi qu’une véritable formation à la conduite de projets de recherche : montage, financement, communication scientifique.

Les cours sont-ils en anglais ?

Oui, la formation est réalisée dans sa globalité en anglais : cours, projets, rapports et soutenances. C’est un vrai atout pour une carrière scientifique internationale, mais cela suppose un niveau d’anglais solide dès l’entrée en M1.

Comment se déroulent les projets et les stages ?

Le cursus repose sur la pratique : une semaine d’intégration, des immersions guidées dans les laboratoires partenaires, puis un projet collectif Junior Lab (8 semaines de construction puis 5 mois de réalisation en petit groupe et en autonomie). En M2, chaque étudiant construit son projet de stage puis réalise un stage individuel de 6 mois, possible à l’étranger, avant de rédiger en équipe un mini article de synthèse.

Peut-on suivre le master en alternance ?

La certification est théoriquement accessible en contrat d’apprentissage et en contrat de professionnalisation, mais dans les faits la formation se suit en formation initiale ou en formation continue, avec une immersion en laboratoire assurée par les projets et les stages. Renseigne-toi auprès des universités sur les modalités réellement ouvertes.

Quels métiers après le master ?

Chargé de mission environnement et développement durable, chargé d’études en biodiversité, chargé de mission en agroécologie, chargé d’études en modélisation, ingénieur (biotechnologie, amélioration des plantes, gestion des espaces naturels, remédiation et dépollution, R&D), responsable de projets de recherche ou chargé de projet pour la transition écologique.

Faut-il forcément poursuivre en doctorat ?

Non, mais c’est une voie naturelle : le master, fortement adossé à la recherche, prépare directement à la thèse, et le stage long de M2 joue souvent un rôle décisif pour décrocher un sujet et un financement. Une insertion à bac+5 est également possible dans les bureaux d’études, les collectivités, l’administration et les entreprises du vivant.

Master Écologie et Biologie Fonctionnelle VS Master Biodiversité, Écologie, Évolution VS Master Biologie Végétale

Les critères clés pour t'aider à choisir ta voie dans l'écologie et les sciences du vivant

Cette formation Master Ecologie et Biologie Fonctionnelle L'interface ecologie-evolution et biologie fonctionnelle, en anglais Master Biodiversite, Ecologie, Evolution La reference pour l'ecologie et la conservation Master Biologie Vegetale Les sciences des plantes, du gene a l'agroecosysteme
Duree / rythme
2 ans (bac +5)Universite · temps plein
2 ans (bac +5)Universite · temps plein
2 ans (bac +5)Universite · temps plein
Alternance
Possible en theorieEn pratique : initiale ou continue
Possible selon parcoursRare
Oui, possibleSelon les universites et parcours
Admission
Mon MasterLicence Sciences de la vie ou equivalentPromotion tres reduite, cursus en anglais
Mon MasterLicence Sciences de la vie ou SVT
Mon MasterLicence Sciences de la vie ou Biologie
Matieres cles
  • Ecologie et evolution
  • Genetique, genomique et biochimie
  • Modelisation et statistiques
  • Conduite de projets de recherche
  • Ecologie des ecosystemes
  • Biologie de la conservation
  • Genetique des populations
  • Physiologie des plantes
  • Genomique vegetale
  • Interactions plantes-microorganismes
Cette formation Master Ecologie et Biologie Fonctionnelle L'interface ecologie-evolution et biologie fonctionnelle, en anglais
Duree / rythme
2 ans (bac +5)Universite · temps plein
Alternance
Possible en theorieEn pratique : initiale ou continue
Admission
Mon MasterLicence Sciences de la vie ou equivalent
Matieres cles
  • Ecologie et evolution
  • Genetique, genomique et biochimie
  • Modelisation et statistiques
Master Biodiversite, Ecologie, Evolution La reference pour l'ecologie et la conservation
Duree / rythme
2 ans (bac +5)
Alternance
Possible selon parcoursRare
Admission
Mon MasterLicence Sciences de la vie ou SVT
Matieres cles
  • Ecologie des ecosystemes
  • Biologie de la conservation
Master Biologie Vegetale Les sciences des plantes, du gene a l'agroecosysteme
Duree / rythme
2 ans (bac +5)
Alternance
Oui, possibleSelon les universites et parcours
Admission
Mon MasterLicence Sciences de la vie ou Biologie
Matieres cles
  • Physiologie des plantes
  • Genomique vegetale

Comment intégrer le Master Écologie et Biologie Fonctionnelle ? 🎯

Pour l’entrée en première année (M1), la candidature se fait via la plateforme nationale Mon Master. Le Master Écologie et Biologie Fonctionnelle est une formation exclusivement publique, proposée sur un site co-accrédité par deux universités, avec une promotion volontairement réduite pour permettre la pédagogie par immersion.

Le master s’adresse aux titulaires d’un diplôme bac+3 ou de tout diplôme jugé équivalent par la commission pédagogique : principalement une licence Sciences de la vie, une licence de Biologie ou une licence SVT. Le cursus étant intégralement en anglais et ouvert à l’international, les candidatures étrangères sont également bienvenues.

Profil d'origine Part des candidats Part des admis Taux d'acces indicatif
Licence Sciences de la vie / Biologie
~60 %
~65 %
~25 %
Licence Sciences de la vie et de la Terre
~20 %
~20 %
~20 %
Autres profils (international, reorientation)
~20 %
~15 %
~15 %
Reperes indicatifs etablis a partir des profils vises par la mention, en l'absence de statistiques officielles Mon Master publiees par profil d'origine. Cette mention tres recente n'est proposee que sur un site co-accredite par deux universites publiques, avec une promotion volontairement reduite : le taux d'acces est donc limite malgre un volume de candidatures modere. Le cursus etant integralement en anglais et fortement tourne vers la recherche, un bon dossier scientifique, un niveau d'anglais solide et un projet oriente recherche font la difference, quel que soit le profil d'origine.

🔄 Intégrer le master en cours de cursus
Une entrée directe en deuxième année (M2) peut être étudiée par la commission pédagogique pour les titulaires d’un M1 compatible en sciences du vivant ou pour des professionnels en formation continue. La cohérence du parcours avec la pédagogie du master (projets menés en équipe, cursus en anglais) est alors examinée de près.

Comment se déroule la sélection ?

La sélection repose sur l’examen du dossier par la commission pédagogique.

Sur le plan académique, les résultats en écologie, génétique, biochimie et statistiques sont regardés en priorité, ainsi que la régularité du parcours de licence et toute première expérience de laboratoire ou de terrain.

Sur le plan du projet, la lettre de motivation doit montrer un intérêt sincère pour la recherche interdisciplinaire et la transition écologique : goût pour l’expérimentation, curiosité pour l’interface entre biologie moléculaire et écologie, envie de travailler en équipe sur des projets longs.

Sur le plan des compétences transversales, un niveau d’anglais solide est indispensable : l’intégralité de la formation, des cours aux soutenances, se déroule en anglais.

Quel est le programme du Master Écologie et Biologie Fonctionnelle ?

La formation s’organise sur quatre semestres (120 ECTS), avec environ 300 heures de cours, travaux dirigés et travaux pratiques complétées par plus de 500 heures de tutorat, le tout intégralement en anglais. Le premier semestre s’ouvre sur une semaine d’intégration puis une série d’immersions guidées dans les laboratoires de recherche partenaires, où enseignants et chercheurs alternent formations théoriques et pratiques ; les étudiants construisent ensuite en petit groupe leur projet Junior Lab. Le deuxième semestre est entièrement consacré à la réalisation de ce projet collectif de recherche, mené en autonomie pendant 5 mois et restitué devant un jury. En deuxième année, le troisième semestre combine un tour d’horizon de la communauté scientifique internationale, la construction du projet de stage individuel puis le début du stage de 6 mois, qui se poursuit au quatrième semestre, possiblement à l’étranger, et s’achève par la rédaction en équipe d’un mini article de synthèse. Trois projets tutorés jalonnent l’ensemble du cursus.

Competence Matieres enseignees Progression
Ecologie, evolution et biologie fonctionnelle
  • Fondamentaux d'ecologie et d'evolution
  • Genetique, genomique et biochimie
  • Immersions guidees dans les laboratoires partenaires
M1 · S1-S2 Acquerir les fondamentaux par immersion dans les equipes de recherche M2 · S3-S4 Mobiliser des savoirs a l'interface des deux champs dans un contexte international
Diagnostic environnemental et espaces naturels
  • Diagnostic d'espaces naturels
  • Impact des activites anthropiques
  • Strategies de restauration et de rehabilitation
M1 · S1-S2 Etablir un diagnostic en mobilisant ecologie, genomique et biochimie M2 · S3-S4 Proposer des strategies de restauration ou de reaffectation d'espaces naturels
Genomique, agroecologie et sante des plantes
  • Amelioration varietale
  • Diagnostic sanitaire des plantes cultivees
  • Approche agroecologique des cultures
M1 · S1-S2 Mobiliser la genetique et la genomique sur des cas concrets M2 · S3-S4 Evaluer les impacts environnementaux des pratiques agricoles et proposer des solutions
Modelisation et analyse de donnees
  • Mathematiques appliquees a la biologie
  • Statistiques et bioinformatique
  • Sequencage nouvelle generation (NGS)
M1 · S1-S2 Prendre en main les outils de modelisation et d'analyse M2 · S3-S4 Modeliser l'evolution d'un systeme naturel dynamique
Conduite de projets de recherche
  • Projet collectif Junior Lab
  • Montage et financement de projets
  • Communication scientifique en anglais
M1 · S1-S2 Construire puis realiser en equipe un projet Junior Lab de 5 mois M2 · S3-S4 Conduire un stage individuel de 6 mois et rediger un mini article de synthese

L'alternance est-elle possible en Master Écologie et Biologie Fonctionnelle ?

Sur le papier, la certification est accessible en contrat d’apprentissage et en contrat de professionnalisation, en plus de la formation initiale et de la formation continue.

Dans les faits, la formation se suit en formation initiale ou en formation continue : la pédagogie par immersion (immersions en laboratoires, projet Junior Lab de 5 mois, stage individuel de 6 mois) occupe l’essentiel du calendrier et remplit le rôle de professionnalisation qu’assure l’alternance dans d’autres mentions. Si tu tiens absolument à un contrat en alternance dans les sciences du vivant, oriente-toi plutôt vers des mentions voisines qui en proposent, ou vérifie auprès des universités si des modalités ont été ouvertes depuis.

Quelles poursuites d'études après le Master Écologie et Biologie Fonctionnelle ?

Le doctorat est la poursuite d’études de référence après ce master fortement adossé à la recherche : c’est d’ailleurs le type de formation explicitement visé par la fiche RNCP. La thèse (3 ans) se prépare en laboratoire public ou en entreprise via une convention CIFRE, sous réserve d’obtenir un sujet et un financement ; le projet Junior Lab et le stage long de M2 constituent des tremplins directs vers un contrat doctoral, en France comme à l’étranger.

D’autres options permettent de compléter le profil : un Mastère Spécialisé (bac+6, label de la Conférence des grandes écoles) pour ajouter une compétence ciblée (environnement, agroécologie, données), ou un MSc à l’international, poursuite naturelle pour un cursus déjà intégralement en anglais.

Formation Duree Admission Selectivite
Doctorat
3 ans (bac +8) These en laboratoire public ou en entreprise (CIFRE)
Dossier + financement Sujet de these, contrat doctoral, ecole doctorale
Elevee
Mastere Specialise
1 an (bac +6) Specialisation pointue (environnement, agroecologie, data...)
Dossier + entretien Parfois tests d'anglais
Moderee a elevee
MSc a l'international
1 a 2 ans Poursuite naturelle pour un cursus deja en anglais
Dossier Tests d'anglais, lettres de recommandation
Variable

Quels sont les débouchés après un Master Écologie et Biologie Fonctionnelle ?

Les diplômés exercent dans l’agriculture, la sylviculture et la pêche, la production et la distribution d’eau, l’assainissement, la gestion des déchets et la dépollution, l’administration publique et les activités scientifiques et techniques du domaine des sciences du vivant. Plus largement, la formation ouvre sur les secteurs Environnement, Agriculture & Agroalimentaire, Gestion de l’eau et Recherche & Enseignement supérieur.

Parmi les métiers concrets exercés par les diplômés, on retrouve : chargé de mission environnement et développement durable, chargé d’études en biodiversité, chargé de mission en agroécologie, chargé d’études en modélisation, ingénieur en biotechnologie, en amélioration des plantes, en protection des végétaux, en gestion des espaces naturels, en remédiation et dépollution ou en recherche et développement, ainsi que conseiller ou animateur, responsable de projets, chargé de projet participatif pour la transition écologique et responsable de projets de recherche scientifique. Après un doctorat, les débouchés s’élargissent aux postes de chercheur et d’enseignant-chercheur.

Quels salaires peut-on espérer après un Master Écologie et Biologie Fonctionnelle ?

Les rémunérations dépendent du type d’employeur : les postes de chargé de mission ou d’études dans les associations, bureaux d’études et collectivités démarrent plus bas que les fonctions d’ingénieur R&D dans les entreprises du vivant. Les fourchettes ci-dessous sont des estimations nationales établies à partir de sources publiques (grilles indiciaires de la fonction publique, APEC, enquêtes d’insertion) : elles constituent des repères indicatifs, pas des garanties.

Metier Debut de carriere Avec experience (3-5 ans)
Charge de mission environnement et developpement durable
2 000 - 2 500 € brut/mois 2 600 - 3 200 € brut/mois
Charge d'etudes en biodiversite
1 900 - 2 400 € brut/mois 2 500 - 3 000 € brut/mois
Ingenieur R&D (biotechnologies, amelioration des plantes)
2 400 - 2 900 € brut/mois 3 000 - 3 800 € brut/mois
Charge d'etudes en modelisation
2 300 - 2 800 € brut/mois 2 900 - 3 600 € brut/mois

Quels établissements proposent le Master Écologie et Biologie Fonctionnelle ?

Chaque université est autonome sur l’organisation de son cursus, sa sélectivité et ses modalités d’admission. Retrouve les pages détaillées : chiffres Mon Master, programme, langue d’enseignement, laboratoires partenaires.

Quelles sont les alternatives au Master Écologie et Biologie Fonctionnelle ?

Le Master Écologie et Biologie Fonctionnelle n’est pas la seule voie : compare toutes les formations du secteur Environnement !

Les universités :

Les écoles de commerce :

Les écoles d’ingénieurs :